学院现设有4个教研室：化学教研室、食品科学与工程教研室、生物工程教研室、环境工程教研室；2个研究所：集美大学食品与生物工程研究所、集美大学环境工程研究所；1个中心：厦门市食品生物工程技术研究中心；3个实验室：福建省高校水产科学技术与食品安全重点实验室、生命科学基础实验中心和食品与生物工程综合实验室。学院配备完善教学实验室，设备先进，利用率高。2006年建成并投入使用的学院综合实验大楼（灿英楼），总建筑面积10821平方米，其中实验室总面积6800余平方米，总投资约1520万元。实验室现有仪器设备总值2012万元，单台800元以上设备1625台套数。学院具有一支整体结构合理、师德师风优良、综合素质高、发展趋势好的师资队伍。现有专任教师70人，省级教学团队1个，专任教师中正高职称11人，副高职称24人，具有博士学位26人，具有硕士学位27人，专任教师中高级职称教师占教师比例50%，具有博士学位教师占37.1%，具有研究生学历教师占75.7%；有省师德先进个人1名，省五一劳动奖章获得者1名，省优秀教师2名，厦门市劳动模范2名，市优秀教师2名，入选“福建省高等学校新世纪优秀人才支持计划”1人，校师德先进个人3名，校优秀教师19名，陈嘉庚奖教金4名，校特聘岗位教授8名。学院先后承担了多项国家自然科学基金、国家科技部攻关、国家863、福建省科技计划、厦门市科技计划等项目的科学研究，取得了一批具有较高学术价值、应用价值的科研成果，并逐渐在水产品加工及其基础研究、农副产品保鲜与加工及综合利用、食品发酵工程、食品安全检测技术、海洋生理活性物质资源开发等方面形成了一定的优势与研究特色，为地方经济建设做出应有的贡献。