目前市场上出现的品种主要有:固氮菌类肥料、根瘤菌类肥料、解磷微生物肥料、硅酸盐肥料、光合肥料、芽胞杆菌制剂、分解作物秸秆制剂、微生物生长调节剂类、复合微生物肥料类、与PGPR类联合使用的制剂以及AM菌根肥料、抗生菌5406肥料等。