目前养殖污水排放相关国家标准有《污水综合排放标准》、《畜禽养殖业污染物排放标准》、《农田灌溉水质标准》。浙江省、山东省和广东省已制定了畜禽养殖业污染物排放地方标准。
我国于1996年发布了《污水综合排放标准》（GB 8978—1996），规定了69种水污染物最高允许排放浓度及部分行业最高允许排水量，其中与养殖污水有关的污染物指标及其限值如下表所示。
污染物 一级水质 二级水质 三级水质BOD5（毫克/升） 30 60 300COD（毫克/升） 100 150 500SS（毫克/升） 70 200 400NH+4-N（毫克/升） 15 25 —P（毫克/升） 0.5 1.0 —硫化物 1.0 1.0 2.0氰化物 0.5 0.5 1.0Cu 0.5 1.0 2.0Zn 2.0 5.0 5.02001年我国针对养殖污水排放制定了《畜禽养殖业污染物排放标准》（GB18596—2001），主要污染物及限值见下表，但是该标准实施已10余年，而且随着社会发展和人们对环保问题的重视，该标准已经不能满足生产和环保要求，目前正在修订中。浙江省、山东省和广东省分别于2005年、2005年和2009年发布了畜禽养殖业污染物排放地方标准DB 33/593—2005、DB 37/534—2005、DB 44/613—2009，这些地方标准根据当地的环保新形势，对养殖污水排放提出了更高要求，这些标准的各项排放参数限值均比GB 18596—2001更低。
污染物指标 标准值BOD5（毫克/升） 150COD（毫克/升） 400SS（毫克/升） 200NH+4-N（毫克/升） 80TP（毫克/升） 8.0粪大肠菌群（个/毫升） 10000蛔虫卵（个/升） 2.0养殖污水除了达标排放外，也可经过适当处理后作为灌溉用水用于农业生产，此时，可参照《农田灌溉水质标准》（GB 5084—2005）执行，该标准对灌溉稻田、旱地和蔬菜的水质分别提出了污染物的限制要求见下表。
污染物 稻田 旱地 蔬菜BOD5（毫克/升） 60 100 40，15COD（毫克/升） 150 200 100，60SS（毫克/升） 80 100 60，15大肠菌（个/100毫升） 4 000 4 000 2 000，1 000蛔虫卵（个/升） 2 2 2，1氯化物 350铅 0.2砷，铬 0.1镉 0.01汞 0.001
